Introdução: Patologias periodontais são um dos principais problemas da cavidade oral de equinos, que podem resultar em problemas de ganho de peso em função da dificuldade na mastigação. Objetivo: Analisar a microbiota oral de equinos da raça quarto de milha, e relacionar ao tipo de alimentação e doenças periodontais. Material e Métodos: O trabalho foi realizado em um Centro de Treinamento de equinos no município de Formiga-MG, foram utilizadas 15 fêmeas equinas, de idades distintas, que realizam atividades de esporte. O exame da microbiota oral foi realizado na parte posterior da língua por meio da coleta por suabe em meio Stuart, estéril e posteriormente o material foi encaminhado para o laboratório de microbiologia do UNIFOR-MG. As amostras foram semeadas em Agar BHI, EMB, MRS e Sal Manitol, e foram isoladas bactérias gram-negativo e gram-positivo do gênero Klebsiella spp., Staphylococcus spp. e Enterococcus spp. Resultados: Os resultados do estudo mostraram maior frequência por Klebsiella spp. em todos os animais seguido por Staphylococcus spp. Conclusão: A cavidade oral de equinos é composta por uma heterogeneidade de micro-organismos, ressaltando a maior prevalência do gênero Klebsiella spp.